“在这一年里，我从来没有忘记把保护人民的生命放在第一位，尽我最大的努力来应对新冠。”9月16日，在菅义伟裁决一周年之际，他对媒体表示。菅义伟上台时，日本的新冠疫情正在蔓延。对当时的菅直人政府来说，应对疫情和恢复经济是最大的挑战。在前首相安倍晋三辞职前夕，大多数人认为他在抗击疫情方面没有效果，民意调查中他的支持率一度低于反对党的支持率。菅义伟在担任官房长官期间和就任后，都把防止疫情蔓延和促进经济复苏放在了首要位置。因此，很多人都在期待，希望这位出身农民家庭、从政40多年的首相能给日本带来新的面貌。

但如何评价其在应对疫情方面的表现?松本，一位住在东京的80多岁老人，告诉The Paper ，因为疫情，他的生活节奏完全被打乱了，他生病时不敢就医，他几乎没有离开过房子。“在我看来，2021年的情况与2020年相比并没有改善。”她说，特别是作为一个老年人，她的健康状况不好。”来形容。面对疫情，菅义伟政府确实反思了以前存在的问题。他曾呼吁实施行政数字化改革，致力于让人们不出门就能随时处理政务，解决医疗资源不足、检测不足等问题。已经采取了一系列措施。

但是，为了搞活经济，他在去年10月疫情警报降低的时候，把东京列入了国内旅游宣传活动“Go to Travel”。虽然宣布将在除东京以外的其他国家实施，但自去年12月停止后一直没有重新启动)，这在一定程度上加剧了疫情的恶化。今年，菅义伟政府多次宣布并取消紧急声明。在病毒剧烈变异的背景下，反复执行政策带来的实际“结果”只是民众的“疲劳”和一波又一波的“威胁性”流行病。“不可否认的是，(菅义伟政府)避免了限制经济活动，在抗击疫情时使用了太多的疫苗，阻止了三角洲突变株在紧急情况下的迅速传播。”《每日新闻》在报道中指出。在应对疫情和恢复经济的双重目标下，菅义伟政府的抗疫政策“迷失”了。